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西瓜疫病主要为害叶、茎蔓和果实，子叶染病，先呈水浸状、暗绿色圆形斑，病斑中央渐变红褐色，茎基部缢缩或枯死。真叶染病，初生水浸状、暗绿色圆形或不规则形斑，扩展迅速，湿度大时，湿烂，像开水烫过似的，干后成淡褐色膜状，易破碎，茎基部染病，产生梭形水浸状、暗绿色凹陷斑，湿烂，围茎一圈植株枯死。果实染病成暗绿色、水浸状凹陷斑，后迅速扩展致果腐烂，病斑密生白色菌丝。 西瓜疫病和黄瓜疫病都是由鞭毛菌亚门，疫霉属真菌侵染引起的发病，其防治方法同“温室黄瓜疫病防治方法”。
