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枯萎病菌属于尖孢镰刀菌，病菌在土壤中存活可达5－6年。病菌从根部伤口及根毛端侵入。在导管中发育，分泌毒素填塞导管，影响水分运输而引起植株萎蔫死亡。如果在栽培中选用抗病同属品种如葫芦、南瓜作砧木进行嫁接，一般可防连作发病。但如果病菌从砧木嫁接口以上的植株伤口进入，也会使植株染病，但病情在防治上就相对比从根部开始感染病害会容易，并且发病程度也会相对减轻。
